14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2937 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2937  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  100 
 
 		 59 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0894  preprotein translocase subunit SecE  76.36 
 
 		 57 aa  89  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00661299  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0900  preprotein translocase subunit SecE  69.09 
 
 		 58 aa  83.6  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2642  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  62.5 
 
 		 59 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1140  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  66.07 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0598453  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0160  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  60.87 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.608101 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2264  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  53.85 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000131465  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0410  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  54.17 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0469451  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1943  preprotein translocase subunit SecE  50.94 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000154853  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0659  protein translocase SEC61 complex gamma subunit  48.94 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000841383  normal  0.782889 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0632  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  47.06 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0369278  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0617  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1584  hypothetical protein  44.44 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000407146  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0865  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  36.36 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>