18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0410 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0410  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  100 
 
 		 69 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0469451  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0160  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  67.65 
 
 		 68 aa  98.6  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.608101 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0659  protein translocase SEC61 complex gamma subunit  68.52 
 
 		 63 aa  82.8  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000841383  normal  0.782889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2264  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  78.26 
 
 		 68 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000131465  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1584  hypothetical protein  53.73 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000407146  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2937  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  54.17 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0900  preprotein translocase subunit SecE  53.19 
 
 		 58 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0632  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  60.87 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0369278  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1943  preprotein translocase subunit SecE  48.39 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000154853  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0894  preprotein translocase subunit SecE  59.09 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00661299  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2642  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  55.32 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0617  preprotein translocase subunit SecE  47.06 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0865  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  46.94 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0143  preprotein translocase subunit SecE  37.31 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.572762  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1238  preprotein translocase subunit SecE  37.31 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0680  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.725215 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1011  preprotein translocase subunit SecE  38.33 
 
 		 85 aa  42.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0746  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.126854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>