19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1238 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1238  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 79 aa  160  6e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0143  preprotein translocase subunit SecE  93.67 
 
 		 79 aa  154  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.572762  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0680  preprotein translocase subunit SecE  91.14 
 
 		 79 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.725215 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0746  preprotein translocase subunit SecE  65.82 
 
 		 78 aa  108  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.126854  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1011  preprotein translocase subunit SecE  58.06 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1943  preprotein translocase subunit SecE  45.9 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000154853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0617  preprotein translocase subunit SecE  43.55 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1584  hypothetical protein  34.29 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000407146  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0632  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  36.71 
 
 		 103 aa  50.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0369278  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0410  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  37.31 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0469451  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04589  protein translocation complex subunit Sss1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06901)  30.65 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0900  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0160  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  34.69 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.608101 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0659  protein translocase SEC61 complex gamma subunit  35.09 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000841383  normal  0.782889 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0865  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  50 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2264  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  31.03 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000131465  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17885  predicted protein  37.25 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2642  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  43.18 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0894  preprotein translocase subunit SecE  46.51 
 
 		 57 aa  40.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00661299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>