17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2642 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2642  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  100 
 
 		 59 aa  114  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1140  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  86.44 
 
 		 59 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0598453  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0900  preprotein translocase subunit SecE  68.97 
 
 		 58 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0894  preprotein translocase subunit SecE  67.86 
 
 		 57 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00661299  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2937  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  62.5 
 
 		 59 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1943  preprotein translocase subunit SecE  60 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000154853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2264  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  55.32 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000131465  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0160  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  54.35 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.608101 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0410  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  55.32 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0469451  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1584  hypothetical protein  46.81 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000407146  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0632  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  53.66 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0369278  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0617  preprotein translocase subunit SecE  47.5 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0659  protein translocase SEC61 complex gamma subunit  42.55 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000841383  normal  0.782889 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1238  preprotein translocase subunit SecE  43.18 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0680  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.725215 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1011  preprotein translocase subunit SecE  36.73 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0143  preprotein translocase subunit SecE  38.64 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.572762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>