15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1011 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1011  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
85 aa  173  6e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1238  preprotein translocase subunit SecE  49.41 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0680  preprotein translocase subunit SecE  50.59 
 
 
79 aa  90.9  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.725215 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0143  preprotein translocase subunit SecE  48.24 
 
 
79 aa  89.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.572762  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0746  preprotein translocase subunit SecE  56.45 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.126854  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1584  hypothetical protein  37.35 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000407146  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0617  preprotein translocase subunit SecE  55.56 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1943  preprotein translocase subunit SecE  51.35 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000154853  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0632  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  31.25 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0369278  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0900  preprotein translocase subunit SecE  44 
 
 
58 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0410  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  38.33 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0469451  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0160  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  32.35 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.608101 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2642  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  36.73 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0865  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  37.5 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0659  protein translocase SEC61 complex gamma subunit  36.36 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000841383  normal  0.782889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>