18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0746 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0746  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
78 aa  159  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.126854  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0680  preprotein translocase subunit SecE  68.35 
 
 
79 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.725215 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1238  preprotein translocase subunit SecE  65.82 
 
 
79 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0143  preprotein translocase subunit SecE  64.56 
 
 
79 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.572762  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1011  preprotein translocase subunit SecE  56.45 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0617  preprotein translocase subunit SecE  48.39 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1943  preprotein translocase subunit SecE  44.83 
 
 
69 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000154853  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1584  hypothetical protein  36.76 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000407146  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0632  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  38.89 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0369278  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0659  protein translocase SEC61 complex gamma subunit  35.59 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000841383  normal  0.782889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2264  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  38.81 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000131465  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17885  predicted protein  32.14 
 
 
73 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0160  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  36.36 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.608101 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0865  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  34.92 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0410  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  33.33 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0469451  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04589  protein translocation complex subunit Sss1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06901)  31.03 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87203  predicted protein  33.33 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.215227 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0900  preprotein translocase subunit SecE  38.3 
 
 
58 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.417951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>