19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0617 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0617  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 71 aa  141  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1943  preprotein translocase subunit SecE  59.42 
 
 		 69 aa  89.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000154853  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1584  hypothetical protein  47.46 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000407146  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0632  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  60.42 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0369278  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0160  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  56.86 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.608101 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2264  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  51.79 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000131465  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0746  preprotein translocase subunit SecE  48.39 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.126854  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0900  preprotein translocase subunit SecE  45.83 
 
 		 58 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1238  preprotein translocase subunit SecE  43.55 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0410  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  47.06 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0469451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0659  protein translocase SEC61 complex gamma subunit  42.37 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000841383  normal  0.782889 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0680  preprotein translocase subunit SecE  45.45 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.725215 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0143  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.572762  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2937  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  50 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0894  preprotein translocase subunit SecE  54.55 
 
 		 57 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00661299  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1011  preprotein translocase subunit SecE  55.56 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2642  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  47.5 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0865  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  39.53 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17885  predicted protein  38.89 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>