36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2087 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2087  TspO and MBR like protein  100 
 
 
169 aa  333  5.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1905  TspO and MBR like protein  34.21 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04610  integral membrane protein  31.17 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0562  TspO and MBR like protein  33.07 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1082  TspO and MBR like protein  30 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1937  TspO and MBR like proteins  31.69 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1390  TspO and MBR like protein  29.63 
 
 
158 aa  58.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2163  TspO and MBR like protein  30.23 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.553393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0177  TspO and MBR like protein  25.47 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0352  TspO and MBR like proteins  24 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.454759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0264  TspO and MBR like protein  28.06 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0662  TspO and MBR like protein  30.08 
 
 
158 aa  53.9  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1305  TspO and MBR like proteins  26.98 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0501  TspO and MBR like protein  29.84 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3722  TspO and MBR like protein  26.87 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1197  TspO and MBR like protein  29.13 
 
 
168 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5100  TspO and MBR like protein  27.82 
 
 
172 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.924689  normal  0.219885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1415  TspO and MBR like protein  30.25 
 
 
170 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491497  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0330  tryptophan-rich sensory protein  28.57 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0547  TspO and MBR like protein  32.28 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3989  TspO and MBR like proteins  26.19 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.204182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1202  TspO and MBR like protein  27.88 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1638  CrtK protein  28.22 
 
 
160 aa  47.8  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0544  TspO and MBR like proteins  31.61 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1687  TspO and MBR like protein  28.24 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1722  TspO and MBR like protein  24.62 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572399  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3744  TspO/MBR family protein  23.81 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  hitchhiker  0.000360645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5368  TspO and MBR like protein  27.69 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.468855  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0158  CrtK protein  28.23 
 
 
158 aa  45.1  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0976779  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2064  TspO and MBR like protein  25.95 
 
 
173 aa  44.3  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200523 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0619  TspO and MBR like protein  30.12 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2240  TspO/MBR family protein  27.1 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0361912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1348  TspO and MBR like protein  26.87 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.984068  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1952  TspO/MBR family protein  27.1 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.354121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0628  TspO and MBR like protein  26.52 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2778  tryptophan-rich sensory protein  25.95 
 
 
163 aa  41.2  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>