22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2202 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2202  transposase  100 
 
 
61 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000987543  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1841  transposase IS4 family protein  56 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2343  transposase IS4 family protein  53.7 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2299  transposase IS4 family protein  56 
 
 
318 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.402383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2493  transposase IS4 family protein  56 
 
 
317 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  0.388463 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0689  transposase  58.82 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000156123  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2040  hypothetical protein  55.56 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000731814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0446  transposase, IS4  56 
 
 
259 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0271  transposase, IS4  51.61 
 
 
223 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1074  transposase IS4 family protein  40 
 
 
273 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2780  transposase IS4 family protein  38.89 
 
 
273 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3087  transposase IS4 family protein  35.19 
 
 
273 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3018  transposase IS4 family protein  35.85 
 
 
273 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3537  transposase IS4 family protein  35.85 
 
 
273 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3404  transposase IS4 family protein  35.85 
 
 
273 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0797  transposase IS4 family protein  37.74 
 
 
273 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.756277  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1186  transposase IS4 family protein  37.74 
 
 
273 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2875  transposase IS4 family protein  35.85 
 
 
273 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4171  transposase IS4 family protein  35.85 
 
 
276 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650477  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4637  transposase IS4 family protein  35.85 
 
 
276 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1220  transposase IS4 family protein  36.54 
 
 
284 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167513  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1573  transposase IS4 family protein  36.54 
 
 
284 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>