41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3404 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3537  transposase IS4 family protein  99.63 
 
 
273 aa  558  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3404  transposase IS4 family protein  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3018  transposase IS4 family protein  99.63 
 
 
273 aa  558  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3087  transposase IS4 family protein  91.21 
 
 
273 aa  522  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2780  transposase IS4 family protein  90.48 
 
 
273 aa  517  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1186  transposase IS4 family protein  85.35 
 
 
273 aa  481  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0797  transposase IS4 family protein  85.71 
 
 
273 aa  483  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.756277  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2875  transposase IS4 family protein  79.85 
 
 
273 aa  461  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1220  transposase IS4 family protein  41.26 
 
 
284 aa  192  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167513  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1573  transposase IS4 family protein  41.26 
 
 
284 aa  192  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1074  transposase IS4 family protein  41.81 
 
 
273 aa  191  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4637  transposase IS4 family protein  38.6 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4171  transposase IS4 family protein  38.24 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650477  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3323  transposase IS4 family protein  40.33 
 
 
287 aa  178  9e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3064  transposase IS4 family protein  36.74 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1190  transposase IS4 family protein  36.74 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000239561  hitchhiker  0.00000551344 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2343  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
349 aa  99  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2299  transposase IS4 family protein  28.08 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.402383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2493  transposase IS4 family protein  27.69 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  0.388463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1841  transposase IS4 family protein  28.09 
 
 
296 aa  96.3  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2090  ISH9-type transposase  38.24 
 
 
146 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2905  putative transposase  87.23 
 
 
48 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0948  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.10326  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1182  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0551  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0793  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.87589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1164  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0446  transposase, IS4  25.86 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0138  transposase IS4 family protein  24.46 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.773027  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1222  transposase IS4 family protein  24.46 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0766  transposase IS4 family protein  24.46 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0247  transposase IS4 family protein  27.41 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00199299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1378  transposase IS4 family protein  28.87 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0271  transposase, IS4  27.49 
 
 
223 aa  53.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2838  hypothetical protein  38.38 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2040  hypothetical protein  42 
 
 
73 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000731814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2038  hypothetical protein  23.98 
 
 
194 aa  46.2  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3284  hypothetical protein  25.69 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693804  decreased coverage  0.00631019 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0689  transposase  40 
 
 
76 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000156123  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2202  transposase  35.85 
 
 
61 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000987543  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  25.35 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>