54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2780 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2780  transposase IS4 family protein  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3087  transposase IS4 family protein  91.94 
 
 
273 aa  524  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3018  transposase IS4 family protein  90.84 
 
 
273 aa  518  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3404  transposase IS4 family protein  90.48 
 
 
273 aa  517  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3537  transposase IS4 family protein  90.84 
 
 
273 aa  518  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1186  transposase IS4 family protein  83.52 
 
 
273 aa  471  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0797  transposase IS4 family protein  83.88 
 
 
273 aa  473  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.756277  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2875  transposase IS4 family protein  78.39 
 
 
273 aa  456  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1074  transposase IS4 family protein  41.38 
 
 
273 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1573  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 
284 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235002 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1220  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 
284 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167513  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4637  transposase IS4 family protein  36.03 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4171  transposase IS4 family protein  35.66 
 
 
276 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650477  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3323  transposase IS4 family protein  37.45 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1190  transposase IS4 family protein  33.71 
 
 
274 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000239561  hitchhiker  0.00000551344 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3064  transposase IS4 family protein  33.71 
 
 
274 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2299  transposase IS4 family protein  27.92 
 
 
318 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.402383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2343  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
349 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2493  transposase IS4 family protein  27.17 
 
 
317 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  0.388463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1841  transposase IS4 family protein  27.34 
 
 
296 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2090  ISH9-type transposase  38.24 
 
 
146 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2905  putative transposase  87.23 
 
 
48 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0446  transposase, IS4  28.07 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0948  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.10326  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0247  transposase IS4 family protein  28.43 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00199299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1378  transposase IS4 family protein  29.38 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0551  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0793  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.87589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1164  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1182  transposase IS4 family protein  24.91 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0138  transposase IS4 family protein  28.29 
 
 
276 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.773027  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1222  transposase IS4 family protein  28.29 
 
 
276 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0766  transposase IS4 family protein  28.29 
 
 
276 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0271  transposase, IS4  29.82 
 
 
223 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2040  hypothetical protein  46 
 
 
73 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000731814  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  33.06 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2838  hypothetical protein  38.38 
 
 
208 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  26.64 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  26.64 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2038  hypothetical protein  23.53 
 
 
194 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0689  transposase  44 
 
 
76 aa  45.8  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000156123  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  24.44 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2202  transposase  38.89 
 
 
61 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000987543  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  24.76 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  31.73 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3284  hypothetical protein  26.79 
 
 
361 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693804  decreased coverage  0.00631019 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  31.73 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  31.73 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  31.73 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  31.73 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  31.73 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  31.73 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  31.73 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  31.73 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>