50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2875 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2875  transposase IS4 family protein  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3018  transposase IS4 family protein  80.22 
 
 
273 aa  462  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3404  transposase IS4 family protein  79.85 
 
 
273 aa  461  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3537  transposase IS4 family protein  80.22 
 
 
273 aa  462  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2780  transposase IS4 family protein  78.39 
 
 
273 aa  456  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3087  transposase IS4 family protein  78.39 
 
 
273 aa  456  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0797  transposase IS4 family protein  81.68 
 
 
273 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.756277  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1186  transposase IS4 family protein  81.68 
 
 
273 aa  457  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1220  transposase IS4 family protein  41.64 
 
 
284 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167513  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1573  transposase IS4 family protein  41.64 
 
 
284 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1074  transposase IS4 family protein  40.95 
 
 
273 aa  185  9e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3323  transposase IS4 family protein  40.33 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4637  transposase IS4 family protein  37.5 
 
 
276 aa  178  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4171  transposase IS4 family protein  36.4 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650477  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1190  transposase IS4 family protein  35.23 
 
 
274 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000239561  hitchhiker  0.00000551344 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3064  transposase IS4 family protein  35.23 
 
 
274 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2343  transposase IS4 family protein  31.03 
 
 
349 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2299  transposase IS4 family protein  32.69 
 
 
318 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.402383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2493  transposase IS4 family protein  31.92 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  0.388463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1841  transposase IS4 family protein  30.25 
 
 
296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2090  ISH9-type transposase  36.03 
 
 
146 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2905  putative transposase  74.47 
 
 
48 aa  75.5  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0948  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.10326  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1378  transposase IS4 family protein  28.35 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0247  transposase IS4 family protein  28.02 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00199299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0766  transposase IS4 family protein  27.86 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1222  transposase IS4 family protein  27.86 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0138  transposase IS4 family protein  27.86 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.773027  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0793  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.87589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0551  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1164  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1182  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.770762  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2038  hypothetical protein  26.47 
 
 
194 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0446  transposase, IS4  27.12 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0271  transposase, IS4  27.23 
 
 
223 aa  52.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3284  hypothetical protein  26.87 
 
 
361 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693804  decreased coverage  0.00631019 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2838  hypothetical protein  34.34 
 
 
208 aa  45.8  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1375  transposase, ISSod6  31.37 
 
 
249 aa  45.4  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  26.53 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0689  transposase  38.46 
 
 
76 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000156123  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  29.8 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  29.8 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2040  hypothetical protein  38 
 
 
73 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000731814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  28.92 
 
 
249 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  27.95 
 
 
249 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  28.92 
 
 
249 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  27.04 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  24.49 
 
 
250 aa  42.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  24.49 
 
 
250 aa  42.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2202  transposase  35.85 
 
 
61 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000987543  normal  0.182592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>