25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1220 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1573  transposase IS4 family protein  100 
 
 
284 aa  589  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235002 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1220  transposase IS4 family protein  100 
 
 
284 aa  589  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167513  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4171  transposase IS4 family protein  64.23 
 
 
276 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650477  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4637  transposase IS4 family protein  63.5 
 
 
276 aa  364  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1074  transposase IS4 family protein  40.79 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3087  transposase IS4 family protein  40.07 
 
 
273 aa  192  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3404  transposase IS4 family protein  41.26 
 
 
273 aa  192  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3018  transposase IS4 family protein  40.89 
 
 
273 aa  192  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3537  transposase IS4 family protein  40.89 
 
 
273 aa  192  6e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2875  transposase IS4 family protein  41.64 
 
 
273 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3323  transposase IS4 family protein  42.35 
 
 
287 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2780  transposase IS4 family protein  39.34 
 
 
273 aa  186  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1186  transposase IS4 family protein  40.07 
 
 
273 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0797  transposase IS4 family protein  39.71 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.756277  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1190  transposase IS4 family protein  35.63 
 
 
274 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000239561  hitchhiker  0.00000551344 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3064  transposase IS4 family protein  35.63 
 
 
274 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2838  hypothetical protein  47.56 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2090  ISH9-type transposase  33.81 
 
 
146 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2493  transposase IS4 family protein  28.35 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  0.388463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2299  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.402383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2343  transposase IS4 family protein  26.79 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1841  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  24.83 
 
 
356 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0446  transposase, IS4  26.46 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0271  transposase, IS4  25.79 
 
 
223 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>