112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2343 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2343  transposase IS4 family protein  100 
 
 
349 aa  728    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2299  transposase IS4 family protein  92.36 
 
 
318 aa  564  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.402383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2493  transposase IS4 family protein  89.9 
 
 
317 aa  559  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  0.388463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1841  transposase IS4 family protein  87.46 
 
 
296 aa  525  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0446  transposase, IS4  52.53 
 
 
259 aa  202  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2038  hypothetical protein  52.63 
 
 
194 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0271  transposase, IS4  50.81 
 
 
223 aa  179  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0208  hypothetical protein  90 
 
 
96 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77637  normal  0.673126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1070  hypothetical protein  47.48 
 
 
142 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2217  hypothetical protein  47.41 
 
 
145 aa  126  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0871  hypothetical protein  84.51 
 
 
103 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0167256  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2875  transposase IS4 family protein  31.03 
 
 
273 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1465  hypothetical protein  74.65 
 
 
111 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2780  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
273 aa  102  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0797  transposase IS4 family protein  27.2 
 
 
273 aa  99.4  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.756277  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3018  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
273 aa  99.4  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3537  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
273 aa  99.4  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1186  transposase IS4 family protein  27.2 
 
 
273 aa  99.4  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3404  transposase IS4 family protein  26.05 
 
 
273 aa  99  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3087  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 
273 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1074  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 
273 aa  93.2  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1164  transposase IS4 family protein  29.57 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1182  transposase IS4 family protein  29.57 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0793  transposase IS4 family protein  29.57 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.87589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0551  transposase IS4 family protein  29.57 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0948  transposase IS4 family protein  29.57 
 
 
276 aa  90.5  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.10326  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1222  transposase IS4 family protein  28.79 
 
 
276 aa  87  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0138  transposase IS4 family protein  28.79 
 
 
276 aa  87  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.773027  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0766  transposase IS4 family protein  28.79 
 
 
276 aa  87  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3284  hypothetical protein  30.04 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693804  decreased coverage  0.00631019 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0247  transposase IS4 family protein  30.85 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00199299  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4637  transposase IS4 family protein  28.73 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4171  transposase IS4 family protein  27.44 
 
 
276 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650477  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1378  transposase IS4 family protein  29.32 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0689  transposase  52.05 
 
 
76 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000156123  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1220  transposase IS4 family protein  26.79 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167513  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1573  transposase IS4 family protein  26.79 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235002 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3323  transposase IS4 family protein  29.02 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2040  hypothetical protein  51.61 
 
 
73 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000731814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2202  transposase  53.7 
 
 
61 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000987543  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0794  hypothetical protein  45.68 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2199  hypothetical protein  58.7 
 
 
49 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00116288  normal  0.42868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  26.86 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  27.27 
 
 
307 aa  52.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3064  transposase IS4 family protein  22.41 
 
 
274 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1190  transposase IS4 family protein  22.41 
 
 
274 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000239561  hitchhiker  0.00000551344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  28.38 
 
 
307 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  28.38 
 
 
307 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  28.38 
 
 
307 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  28.38 
 
 
307 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  28.38 
 
 
307 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  28.38 
 
 
307 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  27.6 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  27.6 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  27.6 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  28.38 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  28.02 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  23.08 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  33.33 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  33.33 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  33.33 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  33.33 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  27.6 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  33.33 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  33.33 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  33.33 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  27.6 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  33.33 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  28 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  27.6 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  27.6 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  27.6 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  27.6 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0948  transposase IS4 family protein  26.16 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1118  transposase IS4 family protein  26.16 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2578  transposase IS4 family protein  26.16 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2684  transposase IS4 family protein  26.16 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  33.33 
 
 
145 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  33.91 
 
 
253 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  33.91 
 
 
249 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01152  hypothetical protein  33.91 
 
 
249 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  33.91 
 
 
253 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  33.91 
 
 
253 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  33.91 
 
 
249 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  28.82 
 
 
307 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  33.91 
 
 
254 aa  46.2  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01953  ISSod6, transposase  30.43 
 
 
249 aa  46.2  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0375505  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  32.5 
 
 
252 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  27.11 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  31.48 
 
 
145 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  31.48 
 
 
145 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0903  hypothetical protein  73.33 
 
 
36 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.296307  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 
146 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  32.79 
 
 
245 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0969  transposase, IS4 family protein  28.24 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>