16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1011 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1011  transposase  100 
 
 
59 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  50.91 
 
 
375 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  49.15 
 
 
390 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  44.07 
 
 
223 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  57.78 
 
 
207 aa  55.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  46.67 
 
 
205 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  47.37 
 
 
205 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0064  transposase  41.67 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  47.37 
 
 
207 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  48.78 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2934  putative transposase  36.54 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  34.62 
 
 
220 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  37.78 
 
 
220 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  37.78 
 
 
220 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  37.78 
 
 
220 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  37.78 
 
 
220 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>