88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2978 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2978  membrane protein-like  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00440647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  50.62 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  55.56 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  48.78 
 
 		 314 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  55.74 
 
 		 298 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  40 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  55.56 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  53.97 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  52.63 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  48.24 
 
 		 304 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  50 
 
 		 300 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  45.24 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  46.05 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  53.23 
 
 		 308 aa  62  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  54.84 
 
 		 309 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  45.12 
 
 		 310 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  52.38 
 
 		 299 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  44.71 
 
 		 299 aa  60.1  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  52.38 
 
 		 299 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1864  hypothetical protein  55 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  52.38 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  37.33 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  42.11 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  40.79 
 
 		 306 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  41.33 
 
 		 306 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  41.33 
 
 		 306 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  38.71 
 
 		 306 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  39.13 
 
 		 318 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  53.23 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  39.13 
 
 		 315 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  39.66 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  42.35 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  41.18 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  52.73 
 
 		 312 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  42.67 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  42.67 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  42.67 
 
 		 306 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  42.67 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  40.26 
 
 		 308 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  42.67 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  40.26 
 
 		 308 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  42.67 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  46.77 
 
 		 321 aa  53.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  39.19 
 
 		 303 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  38.46 
 
 		 304 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  38.46 
 
 		 304 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  38.46 
 
 		 321 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  38.46 
 
 		 304 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  38.46 
 
 		 304 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  38.46 
 
 		 304 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  38.46 
 
 		 321 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  38.46 
 
 		 321 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  38.46 
 
 		 304 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  41.11 
 
 		 305 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  48.57 
 
 		 296 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  34.67 
 
 		 306 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  41.33 
 
 		 306 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  34.67 
 
 		 306 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  34.67 
 
 		 306 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  34.67 
 
 		 306 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  34.67 
 
 		 306 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  34.67 
 
 		 306 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  33.72 
 
 		 303 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  31.65 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  40.35 
 
 		 306 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  38.67 
 
 		 302 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  38.67 
 
 		 302 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  38.67 
 
 		 302 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  38.67 
 
 		 302 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  38.67 
 
 		 302 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  38.67 
 
 		 302 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  38.67 
 
 		 302 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  38.67 
 
 		 302 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  41.33 
 
 		 306 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  47.22 
 
 		 321 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  33.73 
 
 		 303 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  41.07 
 
 		 305 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  39.53 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  47.06 
 
 		 318 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.386659 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02251  UPF0187 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06660)  38.1 
 
 		 499 aa  41.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.493837  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  31.43 
 
 		 309 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  34.55 
 
 		 325 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  34.04 
 
 		 325 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  36.59 
 
 		 310 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  36.59 
 
 		 310 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>