56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R22 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_R22  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0247278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0025  tRNA-Thr  91.23 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000411074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0012  tRNA-Thr  90.2 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000603563  normal  0.0893983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0013  tRNA-Thr  94.74 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0050  tRNA-Thr  92.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111405  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0015  tRNA-Thr  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000030839  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1673  tRNA-Thr  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000301806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2191  tRNA-Thr  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000534865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2233  tRNA-Thr  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000102912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  92.5 
 
 
72 bp  56  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  92.5 
 
 
72 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0012  tRNA-Thr  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000512028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0033  tRNA-Thr  92.11 
 
 
73 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  87.04 
 
 
75 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0009  tRNA-Thr  88 
 
 
75 bp  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0168  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5651  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000701056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0189  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579129  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0026  tRNA-Val  87.04 
 
 
75 bp  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.851542  hitchhiker  0.00348632 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0059  tRNA-Thr  88 
 
 
72 bp  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07727  tRNA-Thr  87.04 
 
 
72 bp  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0034  tRNA-Thr  92.11 
 
 
73 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt07  tRNA-Thr  88 
 
 
72 bp  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5648  tRNA-Thr  92.11 
 
 
73 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000184905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt06  tRNA-Thr  87.93 
 
 
76 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt06  tRNA-Thr  87.93 
 
 
76 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  92.11 
 
 
73 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186681  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1361  tRNA-Thr  90.24 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0042  tRNA-Thr  90.24 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0209686  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0035  tRNA-Thr  90.24 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0047  tRNA-Thr  90.24 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1719  tRNA-Thr  86.54 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778292  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1466  tRNA-Thr  86.54 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000857792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0035  tRNA-Thr  90 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000289059  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  86.54 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0030  tRNA-Thr  96.43 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0013  tRNA-Thr  90 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369049  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tThr03  tRNA-Thr  96.43 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1326  tRNA-Thr  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00274987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0317  tRNA-Thr  88.24 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144022  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0020  tRNA-Thr  86.27 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  84.75 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1871  tRNA-Thr  88.24 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0184728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0035  tRNA-Thr  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0436953  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  85.19 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000131783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0034  tRNA-Thr  89.47 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.175686  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0042  tRNA-Thr  88.1 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000280206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0046  tRNA-Thr  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000374178  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5147  tRNA-Thr  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000364084  normal  0.477803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0017  tRNA-Thr  88.1 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115919  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00332161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0043  tRNA-Thr  86 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>