47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03038 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03038  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1261  hypothetical protein  42 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.185788  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1545  hypothetical protein  40.62 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2892  hypothetical protein  39.39 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0753  hypothetical protein  51.52 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30159  hitchhiker  0.0000000014506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0834  hypothetical protein  42.5 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.18637  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4681  hypothetical protein  50.82 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.516348  hitchhiker  0.00707746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3170  hypothetical protein  32.04 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4545  hypothetical protein  50.82 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0882474  hitchhiker  0.00000435036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3290  hypothetical protein  33.98 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.590792  hitchhiker  0.00000251161 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1338  hypothetical protein  41.89 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1130  hypothetical protein  43.84 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.767588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42540  hypothetical protein  37.35 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1750  hypothetical protein  30.21 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4679  hypothetical protein  50.88 
 
 		 110 aa  57  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357043  hitchhiker  0.0000000000103644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4790  hypothetical protein  39.19 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  hitchhiker  0.00156998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0951  hypothetical protein  30.19 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1619  hypothetical protein  41.79 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2380  glyoxalase I  36.49 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2718  hypothetical protein  41.79 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3442  hypothetical protein  27.62 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1006  hypothetical protein  27.62 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.224873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1059  hypothetical protein  27.62 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002741  hypothetical protein  35.21 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.477975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2651  hypothetical protein  40.3 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.928877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0712  hypothetical protein  37.62 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2825  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  41.79 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1004  hypothetical protein  31.48 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.594  hitchhiker  0.000000000000127796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1512  protein of unknown function DUF446  31.58 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0270212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2644  hypothetical protein  40.3 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.701609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3185  hypothetical protein  46 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.485106  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0853  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000547269  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0410  hypothetical protein  33.01 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.676823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5413  hypothetical protein  32.1 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62180  hypothetical protein  30.39 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3367  protein of unknown function DUF446  26.42 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0379282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0979  hypothetical protein  45.1 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552036  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1471  hypothetical protein  37.1 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0509576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2912  protein of unknown function DUF446  37.31 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0178525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0844  hypothetical protein  37.18 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1435  hypothetical protein  37.1 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1441  hypothetical protein  35.62 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03243  hypothetical protein  32.94 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3172  protein of unknown function DUF446  24.3 
 
 		 106 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2783  tRNA pseudouridine synthase C  33.85 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0934  hypothetical protein  28.79 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000280487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>