66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4681 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4681  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.516348  hitchhiker  0.00707746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4545  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0882474  hitchhiker  0.00000435036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4679  hypothetical protein  98.18 
 
 		 110 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357043  hitchhiker  0.0000000000103644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0753  hypothetical protein  92.52 
 
 		 108 aa  197  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.30159  hitchhiker  0.0000000014506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0844  hypothetical protein  59.26 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0979  hypothetical protein  63.73 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4790  hypothetical protein  62.73 
 
 		 111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  hitchhiker  0.00156998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1004  hypothetical protein  57.14 
 
 		 109 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.594  hitchhiker  0.000000000000127796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62180  hypothetical protein  55.66 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5413  hypothetical protein  54.13 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42540  hypothetical protein  48.54 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0951  hypothetical protein  45.79 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2718  hypothetical protein  53.42 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2892  hypothetical protein  44.66 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2651  hypothetical protein  52.05 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.928877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2825  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  52.05 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0712  hypothetical protein  44.44 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1471  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0509576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1435  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3290  hypothetical protein  38.78 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.590792  hitchhiker  0.00000251161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2912  protein of unknown function DUF446  50 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0178525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2644  hypothetical protein  44.21 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.701609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1545  hypothetical protein  40.22 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1338  hypothetical protein  48.61 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1619  hypothetical protein  47.95 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3172  protein of unknown function DUF446  38.78 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1441  hypothetical protein  47.62 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0834  hypothetical protein  40.22 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.18637  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1130  hypothetical protein  46.05 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.767588 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3170  hypothetical protein  37.78 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3367  protein of unknown function DUF446  38 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0379282  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2380  glyoxalase I  40.21 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3797  hypothetical protein  38.46 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1750  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2988  protein of unknown function DUF446  37 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1512  protein of unknown function DUF446  46.25 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0270212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3650  hypothetical protein  34.26 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1059  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3442  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1006  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.224873  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0853  hypothetical protein  35.8 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000547269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0934  hypothetical protein  35.85 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000280487  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1261  hypothetical protein  40.74 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.185788  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002741  hypothetical protein  36.56 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.477975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03243  hypothetical protein  53.85 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1489  hypothetical protein  45 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03038  hypothetical protein  50.82 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3245  hypothetical protein  36.46 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3185  hypothetical protein  42.11 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.485106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2932  hypothetical protein  38.1 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0920  hypothetical protein  36.9 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3080  hypothetical protein  36.9 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02599  hypothetical protein  36.9 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.714379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0410  hypothetical protein  52 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.676823  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02637  hypothetical protein  36.9 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.661545  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2936  hypothetical protein  36.9 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0896  protein of unknown function DUF446  36.9 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154831  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4055  hypothetical protein  36.9 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3096  hypothetical protein  36.9 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.375581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2783  tRNA pseudouridine synthase C  32.43 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3172  hypothetical protein  29.35 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0422964  normal  0.23852 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3188  putative cytoplasmic protein  29.35 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3287  hypothetical protein  31.17 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.469004  normal  0.845638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3107  hypothetical protein  31.17 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3125  domain of unknown function superfamily  31.25 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.477975  normal  0.699965 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1243  hypothetical protein  31.03 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>