More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00700 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  76.37 
 
 		 704 aa  776    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  76.37 
 
 		 704 aa  776    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  66.81 
 
 		 692 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0451  elongation factor G  71.01 
 
 		 715 aa  706    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163293  unclonable  0.000000517484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4111  elongation factor G  71.58 
 
 		 703 aa  704    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0335  elongation factor G  70.25 
 
 		 700 aa  698    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000657567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  72.78 
 
 		 698 aa  729    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0200  elongation factor G  68.35 
 
 		 700 aa  678    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0641168  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  69.2 
 
 		 703 aa  697    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0804  elongation factor G  70.04 
 
 		 700 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.0692379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3919  elongation factor G  75.74 
 
 		 702 aa  759    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000296872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  79.54 
 
 		 699 aa  801    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  67.23 
 
 		 692 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  70.34 
 
 		 699 aa  719    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  78.06 
 
 		 698 aa  768    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0623  translation elongation factor G  72 
 
 		 701 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4279  translation elongation factor G  77 
 
 		 697 aa  769    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000062878  unclonable  0.0000000000098696 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  70.25 
 
 		 709 aa  720    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  68.57 
 
 		 700 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  77.64 
 
 		 698 aa  767    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  72 
 
 		 704 aa  695    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  68.57 
 
 		 700 aa  688    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  73.62 
 
 		 694 aa  728    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  73.62 
 
 		 694 aa  728    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4551  elongation factor G  71.58 
 
 		 701 aa  693    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  70.68 
 
 		 708 aa  718    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0316  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  70.46 
 
 		 697 aa  702    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000146619  hitchhiker  0.000265017 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  69.2 
 
 		 702 aa  697    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5535  elongation factor G  71.94 
 
 		 701 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.873781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  70.46 
 
 		 696 aa  715    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  68.57 
 
 		 700 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  72 
 
 		 704 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  68.57 
 
 		 700 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  73.63 
 
 		 697 aa  738    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5082  elongation factor G  72.42 
 
 		 701 aa  708    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000061463  normal  0.350289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  64.56 
 
 		 692 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  69.2 
 
 		 700 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5860  elongation factor G  70.95 
 
 		 701 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0952  elongation factor G  71.79 
 
 		 802 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3757  elongation factor G  76.58 
 
 		 704 aa  769    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000182593  decreased coverage  0.00156911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  65.96 
 
 		 692 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0292  translation elongation factor G  73.84 
 
 		 700 aa  721    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000300154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3223  elongation factor G  73.26 
 
 		 730 aa  721    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  78.06 
 
 		 698 aa  769    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  70.32 
 
 		 696 aa  719    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  76.16 
 
 		 701 aa  742    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0155  elongation factor G  79.96 
 
 		 698 aa  756    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0129651  decreased coverage  0.0000592155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  65.75 
 
 		 692 aa  647    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  71.58 
 
 		 704 aa  692    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  68.57 
 
 		 700 aa  688    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  68.57 
 
 		 700 aa  688    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3438  translation elongation factor G  75.74 
 
 		 697 aa  731    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000152425  hitchhiker  0.000196406 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0050  elongation factor G  69.41 
 
 		 700 aa  666    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000481865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0834  elongation factor G  73.42 
 
 		 706 aa  716    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.757744  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  68.57 
 
 		 700 aa  686    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  75.74 
 
 		 701 aa  734    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0861  elongation factor G  73.42 
 
 		 698 aa  720    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  65.61 
 
 		 697 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  68.57 
 
 		 700 aa  704    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  70.04 
 
 		 704 aa  700    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  68.78 
 
 		 700 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  71.94 
 
 		 701 aa  705    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  77 
 
 		 698 aa  742    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  77.64 
 
 		 698 aa  767    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  76.79 
 
 		 706 aa  754    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  68.57 
 
 		 700 aa  688    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  70.68 
 
 		 708 aa  718    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  69.2 
 
 		 703 aa  697    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5930  elongation factor G  72.57 
 
 		 702 aa  707    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0494  translation elongation factor G  69.6 
 
 		 705 aa  709    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2123  elongation factor G  72 
 
 		 704 aa  695    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3446  elongation factor G  69.41 
 
 		 700 aa  691    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.607272  normal  0.483871 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1916  elongation factor G  70.95 
 
 		 747 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  68.78 
 
 		 700 aa  690    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0548  elongation factor G  72 
 
 		 704 aa  695    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0602  translation elongation factor G  87.34 
 
 		 701 aa  857    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000132615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  70.46 
 
 		 700 aa  701    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0275  elongation factor G  68.14 
 
 		 702 aa  669    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.374019  hitchhiker  0.000000209293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1636  elongation factor G  70.32 
 
 		 699 aa  671    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.808176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  75.74 
 
 		 700 aa  768    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  78.69 
 
 		 698 aa  775    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  78.69 
 
 		 698 aa  775    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0455  elongation factor G  77.22 
 
 		 699 aa  744    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  78.27 
 
 		 698 aa  773    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  68.57 
 
 		 700 aa  688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  68.99 
 
 		 700 aa  693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2576  elongation factor G  71.37 
 
 		 703 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.275425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08820  elongation factor G  73.42 
 
 		 706 aa  716    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.569469  normal  0.0264606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37710  elongation factor G  73.47 
 
 		 702 aa  719    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0956  elongation factor G  71.79 
 
 		 801 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0484  elongation factor G  71.01 
 
 		 715 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00540157  normal  0.0564754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  68.78 
 
 		 700 aa  690    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2528  elongation factor G  71.37 
 
 		 703 aa  689    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3912  elongation factor G  71.84 
 
 		 715 aa  712    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0314456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  78.9 
 
 		 698 aa  779    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1261  elongation factor G  69.41 
 
 		 700 aa  680    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1753  elongation factor G  70.95 
 
 		 703 aa  702    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.751097  normal  0.0412886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  67.44 
 
 		 692 aa  665    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2773  elongation factor G  80.38 
 
 		 698 aa  766    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000856998  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  78.48 
 
 		 698 aa  780    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>