49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1774 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1774  IS30 family transposase  100 
 
 
197 aa  412  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2303  integrase catalytic subunit  32.81 
 
 
347 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000160202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0574  integrase catalytic subunit  32.81 
 
 
347 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000257634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1957  integrase catalytic subunit  32.81 
 
 
347 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0628  IS1470, transposase  25.53 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.19443  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0712  IS1470, transposase  25.53 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0383  IS1470, transposase  25.53 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0379  IS1470, transposase  25.53 
 
 
350 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.728113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1088  IS1470, transposase  25.53 
 
 
350 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.958304  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1373  IS1470, transposase  25.53 
 
 
350 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.111224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1078  IS1470, transposase  25.53 
 
 
350 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0967  IS1470, transposase  25.53 
 
 
350 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.666025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0321  IS1470, transposase  25.53 
 
 
350 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0314  IS1470, transposase  25.53 
 
 
350 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0659  IS1470, transposase  25.53 
 
 
268 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0648  IS1470, transposase  25.53 
 
 
350 aa  62  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2401  IS1470 transposase  25.53 
 
 
350 aa  62  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000104485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1578  IS1470, transposase  23.53 
 
 
154 aa  48.9  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000377469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0496  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
370 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2716  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
370 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000665461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3182  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
370 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.815282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2173  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
370 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0370565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1712  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
370 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1469  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
370 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1242  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
370 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0128  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
370 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.763879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0141  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
370 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000388252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0159  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
370 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.988546  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1752  ISTde2, transposase  27.05 
 
 
358 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1022  ISTde2, transposase  27.05 
 
 
358 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0477791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0140  ISTde2, transposase  27.05 
 
 
358 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>