151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0462 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0462  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 72 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00357731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  55.56 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  54.17 
 
 		 72 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  58.11 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  51.43 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  53.73 
 
 		 77 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  54.69 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  54.69 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  54.69 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  63.27 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  58.18 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  56 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  47.76 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  48.48 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  51.92 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  46.88 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  54.72 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  44.93 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  52.83 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0857  F0F1 ATP synthase subunit C  43.48 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00162341  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  42.25 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  38.36 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4796  ATP synthase F0, C subunit  64.86 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000270119  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  41.79 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1874  F0F1-type ATP synthase, subunit c  53.85 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  47.27 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  44.78 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  47.27 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  44.12 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0515  F0F1 ATP synthase subunit C  39.13 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000303287  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  42.65 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000213686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  42.65 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  45.28 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  45.28 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  41.18 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000405757  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  44.64 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  37.25 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  35.09 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  34.85 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  41.82 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  45.31 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4245  F0F1 ATP synthase subunit C  51.02 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000128569  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2802  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0121478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  33.82 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1939  F0F1 ATP synthase subunit C  36.96 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000147682  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  37.31 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  44.12 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  36.62 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  44.12 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  44.12 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04088  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0194198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4612  F0F1 ATP synthase subunit C  45.83 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  42.19 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1643  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.915804  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  42.65 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  42.65 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  40 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40.91 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3961  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.418687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52210  F0F1 ATP synthase subunit C  43.75 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  49.12 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  34.29 
 
 		 74 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  44.07 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2647  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2292  ATP synthase F0, C subunit  45.83 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.64 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  35.19 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  36.51 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  35.38 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  32.88 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  37.88 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  38 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>