91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1874 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1874  F0F1-type ATP synthase, subunit c  100 
 
 
75 aa  142  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  53.52 
 
 
72 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  53.52 
 
 
72 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  53.52 
 
 
72 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  53.52 
 
 
72 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  53.52 
 
 
72 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  53.52 
 
 
72 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  53.52 
 
 
72 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  53.52 
 
 
72 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  53.52 
 
 
72 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  53.52 
 
 
72 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  52.11 
 
 
72 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  48.57 
 
 
70 aa  74.3  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  48.48 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  48.48 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  48.48 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  49.3 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  51.92 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  44.83 
 
 
79 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 
74 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  47.76 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  51.92 
 
 
70 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  43.24 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  41.38 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  44.12 
 
 
78 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  47.22 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  48.98 
 
 
85 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  42.47 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0462  ATP synthase F0, C subunit  52.5 
 
 
72 aa  50.1  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00357731  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  38.24 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2292  ATP synthase F0, C subunit  42.19 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  37.25 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  36 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  43.06 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  43.06 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  33.33 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  31.51 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  41.82 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  38.67 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  31.51 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  33.77 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  33.77 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  31.51 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  32.88 
 
 
91 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  42.47 
 
 
71 aa  47  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  35.62 
 
 
74 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  32.35 
 
 
95 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  31.51 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  31.51 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  32.88 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1939  F0F1 ATP synthase subunit C  42.55 
 
 
71 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000147682  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  38.1 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  45.28 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  31.51 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  35.71 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  34.78 
 
 
76 aa  42.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  34.48 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4796  ATP synthase F0, C subunit  48.65 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000270119  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  27.4 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  36.11 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 
87 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  39.29 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  33.33 
 
 
75 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  36.36 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0857  F0F1 ATP synthase subunit C  34.78 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00162341  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  36.36 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  36.76 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3079  ATP synthase F0, C subunit  28.57 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268592  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  37.04 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  33.8 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  38 
 
 
77 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1176  F0F1 ATP synthase subunit C  32.93 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.575473  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1278  F0F1 ATP synthase subunit C  32.93 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.453948  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0648  F0F1 ATP synthase subunit C  44.19 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.157082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  37.04 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
85 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000405757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>