134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1939 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1939  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 71 aa  133  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000147682  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0857  F0F1 ATP synthase subunit C  48.44 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00162341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0515  F0F1 ATP synthase subunit C  46.77 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000303287  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  56.67 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  56.67 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  56.67 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  45 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  45.31 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  44.26 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  42.47 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  40.54 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  40.58 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  41.27 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0305  F0F1 ATP synthase subunit C  43.1 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000326733  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.44 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  43.1 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  41.43 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  42.42 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2749  F0F1 ATP synthase subunit C  41.38 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000357567  normal  0.274405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  43.1 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  41.38 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  45.83 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  43.42 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  44.83 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  43.1 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  43.1 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  43.1 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  48.08 
 
 		 77 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  38.98 
 
 		 111 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  43.1 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  43.1 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  36.67 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  36.67 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  36.67 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  36.67 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0367  ATP synthase F0, C subunit  40.98 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  48.94 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  45.65 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3079  ATP synthase F0, C subunit  36.11 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  45.1 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2802  F0F1 ATP synthase subunit C  45.33 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0121478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  40 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  35 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  42.37 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  35.48 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  49.12 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  45.61 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  36.67 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1666  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  45.07 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3961  F0F1 ATP synthase subunit C  45.9 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.418687  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  43.84 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  34.43 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  42.47 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  42.47 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4245  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000128569  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  36.17 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  41.27 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  43.86 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  35.71 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.27 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  39.68 
 
 		 321 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  35.48 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  41.18 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  43.75 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  37.88 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04088  F0F1 ATP synthase subunit C  54.76 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0194198  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  39.34 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  35.85 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  35.85 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  35.85 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2292  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.567074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  38.71 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  44.83 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  44.83 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  34.78 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5126  F0F1 ATP synthase subunit C  40.98 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00154985  normal  0.574958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>