233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4796 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4796  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
76 aa  143  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000270119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  58.46 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  58.46 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  58.46 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  58.46 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  60 
 
 
79 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  58.46 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  58.46 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  58.46 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  58.46 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  58.46 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  58.46 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  58.46 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 
70 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  52.05 
 
 
76 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 
70 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 
70 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  57.53 
 
 
77 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  65.38 
 
 
85 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  59.57 
 
 
70 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  50.67 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  55.38 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  43.59 
 
 
81 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  43.59 
 
 
81 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  43.08 
 
 
70 aa  61.2  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  43.59 
 
 
81 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  43.59 
 
 
81 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  39.19 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  42.31 
 
 
82 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  42.31 
 
 
82 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  42.31 
 
 
111 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  56.36 
 
 
74 aa  60.1  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  52 
 
 
77 aa  60.1  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  53.33 
 
 
77 aa  60.1  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  51.56 
 
 
73 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  47.06 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  41.03 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  43.4 
 
 
82 aa  58.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  53.23 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  45.83 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
73 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 
76 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 
76 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  47.3 
 
 
78 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  44.59 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0462  ATP synthase F0, C subunit  59.52 
 
 
72 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00357731  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  37.84 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  37.84 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  39.19 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  43.06 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1800  ATP synthase F0, C subunit  50.72 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.217172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  44.29 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  44.29 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  44.29 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000213686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  35.14 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  52.46 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  38.03 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  40 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  36.49 
 
 
91 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  38.67 
 
 
100 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  32.89 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  35.14 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  38.67 
 
 
100 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  46.05 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  47.22 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  48.28 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  36.49 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  36.49 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  39.73 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  33.78 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  48.28 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  33.78 
 
 
91 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 
77 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  29.73 
 
 
93 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  49.28 
 
 
81 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  28.38 
 
 
92 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  33.78 
 
 
91 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3079  ATP synthase F0, C subunit  36 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  30.26 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000405757  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  48.39 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  41.18 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  47.17 
 
 
73 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  48.33 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  43.33 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  42.11 
 
 
81 aa  50.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  47.69 
 
 
81 aa  50.8  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  41.89 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  48.44 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  45.61 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  39.47 
 
 
82 aa  50.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3971  F0F1 ATP synthase subunit C  44.07 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000527403  normal  0.270101 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0943976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>