240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0814 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0814  BolA family protein  100 
 
 
103 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0665  BolA family protein  100 
 
 
103 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  48.19 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  38.14 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  48.19 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  47.13 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  46.67 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000171225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  42.7 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  44.16 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  36.9 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0204  transcriptional regulator BolA  37.25 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  40 
 
 
101 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  40.24 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5212  transcriptional regulator BolA  53.25 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  45.45 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  42.5 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  38.2 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  41.03 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  39.53 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  35.63 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  44.78 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  37.5 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  44.74 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  41.18 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  43.84 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  39.02 
 
 
93 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1899  BolA family protein  51.95 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  32.63 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  37.8 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  46.15 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1934  BolA family protein  51.95 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139583  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0782  BolA family protein  31.4 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  44.74 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  36.47 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  36.05 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6168  BolA-like protein  51.95 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  42.31 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1911  BolA family protein  51.95 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1829  BolA family protein  51.95 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367747  normal  0.761747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  41.86 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  44.3 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  41.89 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1443  BolA-like protein  49.35 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2387  BolA-like protein  47.37 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1207  BolA-like protein  49.35 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1363  BolA family protein  51.95 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2300  BolA/YrbA family protein  49.35 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424881  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  41.89 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1934  BolA-like protein  49.35 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3371  BolA-like protein  49.35 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2339  BolA/YrbA family protein  49.35 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  43.06 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2137  BolA-like protein  51.35 
 
 
106 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  42.25 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  37.5 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  40.54 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  34.78 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  39.02 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  34.78 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  36.99 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2279  putative stress-induced morphogene BolA- like protein  49.37 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  36.56 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  34.94 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  39.02 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  36.47 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  36.84 
 
 
192 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  49.15 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  35 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  39.47 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1921  BolA family protein  49.28 
 
 
106 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066107  normal  0.787426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  37.21 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  39.73 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  34.09 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  33.72 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  33.72 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  37.21 
 
 
99 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  33.72 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  33.72 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  33.72 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  50 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  34.09 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  50 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  50 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  50 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  50 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  50 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  50 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  50 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  40.68 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  35.62 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  38.36 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  35.29 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  35.29 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  39.02 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  38.96 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  31.11 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  32.22 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  48.15 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  41.46 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  44.07 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>