47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_t0018 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_t0018  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0023  tRNA-Thr  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00654799  normal  0.745074 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0006  tRNA-Thr  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132587  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0404  tRNA-Thr  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.440416  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0442  tRNA-Thr  91.04 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt014  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0018476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0027  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0028  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00544508  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0604  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.398612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0001  tRNA-Thr  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0029  tRNA-Thr  84.85 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0158  tRNA-Thr  84.85 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0169  tRNA-Thr  84.85 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0025  tRNA-Thr  84.85 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0064  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0700  tRNA-Thr  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1198  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2177  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2220  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1226  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.186423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0049  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00205425  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0004  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0108141  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0028  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0780  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0042  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.22955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0001  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0045  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0302111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0010    88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt07  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0008  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0035    86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00887484  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4318  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0006  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0015  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.951342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna022  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000131099  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3097t  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0017  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0010  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87354  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna6  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.349793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0028  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0418849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0050  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130847  hitchhiker  0.00000000426742 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00485  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0066  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1858  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>