33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1891 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1891  competence protein  100 
 
 
327 aa  667    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0804  competence protein CoiA  40.06 
 
 
315 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0488  competence protein, transcription factor  41.92 
 
 
319 aa  199  6e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1113  hypothetical protein  42.28 
 
 
414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1095  competence protein  42.28 
 
 
414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1205  hypothetical protein  42.28 
 
 
414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1275  hypothetical protein  42.28 
 
 
414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1351  hypothetical protein  42.28 
 
 
414 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1089  competence protein  41.61 
 
 
414 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1246  hypothetical protein  41.61 
 
 
414 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4095  hypothetical protein  40.27 
 
 
414 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1313  hypothetical protein  38.37 
 
 
411 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1101  competence CoiA family protein  40.13 
 
 
411 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0908  competence CoiA family protein  34.88 
 
 
411 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1161  competence protein  34.66 
 
 
362 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0767  Competence CoiA family protein  34.67 
 
 
412 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1622  Competence CoiA family protein  32.21 
 
 
442 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0569  competence CoiA family protein  30.51 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1017  competence CoiA family protein  37.14 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00151729  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0998  competence CoiA family protein  37.14 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.558587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0579  competence protein, putative  34.69 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.611059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2139  hypothetical protein  25.48 
 
 
275 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885701  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1357  competence protein  25.88 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000492199  normal  0.0337065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2883  myosin N-terminal SH3-like domain-containing protein  29.36 
 
 
214 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3015  putative competence protein  28.17 
 
 
233 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5067  hypothetical protein  28.03 
 
 
279 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6764  hypothetical protein  30.11 
 
 
473 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167002 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4337  hypothetical protein  26.92 
 
 
385 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.478292  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4410  competence protein-like  27.45 
 
 
273 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.68266  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4553  hypothetical protein  32.56 
 
 
210 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.86686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1243  hypothetical protein  31.37 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0437  putative glutathione peroxidase  25.17 
 
 
188 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.444541 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0885  competence protein-like protein  27.69 
 
 
349 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.558763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>