17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3015 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3015  putative competence protein  100 
 
 		 233 aa  485  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3145  putative competence protein  45.06 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4410  competence protein-like  45.79 
 
 		 273 aa  191  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.68266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1243  hypothetical protein  45.4 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1701  hypothetical protein  50.75 
 
 		 218 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267807  normal  0.0333015 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2139  hypothetical protein  46.15 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885701  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4553  hypothetical protein  39.77 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.86686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0036  competence protein; transcription factor  40.16 
 
 		 316 aa  99  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268846  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2883  myosin N-terminal SH3-like domain-containing protein  32.21 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0953  hypothetical protein  29.79 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1891  competence protein  28.17 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0569  competence CoiA family protein  27.04 
 
 		 344 aa  45.8  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0908  competence CoiA family protein  24.26 
 
 		 411 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0767  Competence CoiA family protein  25.93 
 
 		 412 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1017  competence CoiA family protein  25.73 
 
 		 328 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00151729  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0998  competence CoiA family protein  25.73 
 
 		 328 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.558587  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1161  competence protein  23.46 
 
 		 362 aa  43.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>