14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1243 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1243  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1701  hypothetical protein  55.25 
 
 		 218 aa  258  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267807  normal  0.0333015 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4553  hypothetical protein  43.9 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.86686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3015  putative competence protein  45.4 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4410  competence protein-like  55.8 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.68266  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3145  putative competence protein  42.93 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2139  hypothetical protein  49.19 
 
 		 275 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885701  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0036  competence protein; transcription factor  41.8 
 
 		 316 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268846  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2883  myosin N-terminal SH3-like domain-containing protein  35.56 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0953  hypothetical protein  33.94 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0908  competence CoiA family protein  27.91 
 
 		 411 aa  48.5  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1891  competence protein  31.37 
 
 		 327 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1246  hypothetical protein  28.33 
 
 		 414 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4095  hypothetical protein  26.89 
 
 		 414 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>