17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2139 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2139  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2104  hypothetical protein  80 
 
 
176 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4410  competence protein-like  50.39 
 
 
273 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.68266  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1701  hypothetical protein  41.72 
 
 
218 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267807  normal  0.0333015 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4553  hypothetical protein  43.14 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.86686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1243  hypothetical protein  49.19 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3015  putative competence protein  46.15 
 
 
233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3145  putative competence protein  46.56 
 
 
270 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0036  competence protein; transcription factor  29.32 
 
 
316 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268846  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2883  myosin N-terminal SH3-like domain-containing protein  42.52 
 
 
214 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1891  competence protein  25.48 
 
 
327 aa  59.3  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0804  competence protein CoiA  30.91 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0953  hypothetical protein  26.67 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3920  metallophosphoesterase  30.53 
 
 
599 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1377  metallophosphoesterase  29.47 
 
 
561 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.800783  normal  0.10205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3887  twin-arginine translocation pathway signal  27.37 
 
 
628 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5821  metallophosphoesterase  27.37 
 
 
577 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362346  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>