22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4410 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4410  competence protein-like  100 
 
 
273 aa  560  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.68266  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3145  putative competence protein  43.98 
 
 
270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3015  putative competence protein  45.79 
 
 
233 aa  191  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1243  hypothetical protein  55.8 
 
 
220 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1701  hypothetical protein  53.68 
 
 
218 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267807  normal  0.0333015 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2139  hypothetical protein  50.39 
 
 
275 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885701  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4553  hypothetical protein  41.24 
 
 
210 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.86686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0036  competence protein; transcription factor  39.47 
 
 
316 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268846  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2883  myosin N-terminal SH3-like domain-containing protein  34.67 
 
 
214 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0953  hypothetical protein  27.89 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0908  competence CoiA family protein  25.2 
 
 
411 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1101  competence CoiA family protein  21.64 
 
 
411 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4095  hypothetical protein  22.39 
 
 
414 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1891  competence protein  27.45 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1246  hypothetical protein  24.06 
 
 
414 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1089  competence protein  20.15 
 
 
414 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1351  hypothetical protein  19.4 
 
 
414 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1205  hypothetical protein  19.4 
 
 
414 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1275  hypothetical protein  19.4 
 
 
414 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1095  competence protein  19.4 
 
 
414 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1113  hypothetical protein  19.4 
 
 
414 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1313  hypothetical protein  21.05 
 
 
411 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>