21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0579 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0579  competence protein, putative  100 
 
 		 326 aa  673    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.611059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1017  competence CoiA family protein  37.85 
 
 		 328 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00151729  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0998  competence CoiA family protein  37.85 
 
 		 328 aa  228  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.558587  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1891  competence protein  34.69 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0569  competence CoiA family protein  29.24 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0767  Competence CoiA family protein  27.7 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1089  competence protein  34.36 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1113  hypothetical protein  33.74 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1095  competence protein  33.74 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1205  hypothetical protein  33.74 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1275  hypothetical protein  33.74 
 
 		 414 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1313  hypothetical protein  37.01 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0488  competence protein, transcription factor  32.85 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4095  hypothetical protein  35.29 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1351  hypothetical protein  34.21 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0908  competence CoiA family protein  28.57 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1161  competence protein  28.5 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1246  hypothetical protein  24.54 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1622  Competence CoiA family protein  23.17 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1101  competence CoiA family protein  32.61 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0804  competence protein CoiA  31.91 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>