16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1374 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1374  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0581  hypothetical protein  90.62 
 
 
265 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0660  hypothetical protein  90.62 
 
 
265 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0270681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  39.66 
 
 
280 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  37.93 
 
 
280 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  37.93 
 
 
277 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  32.79 
 
 
291 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  31.34 
 
 
284 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  34.48 
 
 
306 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  34.48 
 
 
306 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  34.62 
 
 
277 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  29.85 
 
 
295 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  35.19 
 
 
308 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  37.04 
 
 
286 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  29.63 
 
 
297 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  29.31 
 
 
302 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>