56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2720 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2720  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
217 aa  431  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0920  CheC, inhibitor of MCP methylation  59.52 
 
 
211 aa  255  4e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2852  CheC, inhibitor of MCP methylation  56.93 
 
 
200 aa  232  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0462024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2156  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.04 
 
 
197 aa  223  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220055  normal  0.484045 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0957  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.81 
 
 
201 aa  150  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3148  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.31 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2376  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.17 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.341439  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.87 
 
 
406 aa  124  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.72 
 
 
422 aa  120  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.65 
 
 
418 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0236  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.49 
 
 
403 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0935  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.81 
 
 
212 aa  109  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2562  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.16 
 
 
399 aa  98.2  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.348957  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2876  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.69 
 
 
406 aa  96.3  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.98 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.29 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0179  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.07 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1723  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.9 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.348388  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0739  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.76 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.91151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  25.17 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.42 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.04 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.58 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.57 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.48 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.31 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.83 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.7 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.22 
 
 
197 aa  55.1  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.17 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  24.87 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0257  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.68 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1151  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.83 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.9 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.01 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.53 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.68 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.19 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.71 
 
 
204 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.05 
 
 
546 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.86 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.71 
 
 
204 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.56 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.42 
 
 
204 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.85 
 
 
207 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.77 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.81 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  54.05 
 
 
1010 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.11 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  29.2 
 
 
406 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0738  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.92 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.972818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.05 
 
 
213 aa  42.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.6 
 
 
205 aa  42  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1724  CheC, inhibitor of MCP methylation  18.75 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.92 
 
 
198 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>