19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1905 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  268  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  48.42 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  31.71 
 
 
115 aa  58.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  34.48 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  31.15 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  31.4 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  32.23 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  27.68 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  30.97 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  26.72 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  29.82 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  25.2 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1083  hypothetical protein  27.62 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  27.59 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  30.08 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0688  hypothetical protein  31.33 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353875  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1113  hypothetical protein  30.49 
 
 
115 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.341492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  32.14 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>