18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0869 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  229  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  67.54 
 
 
114 aa  160  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  54.87 
 
 
113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  51.33 
 
 
113 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  51.33 
 
 
113 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  51.33 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  53.04 
 
 
115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  50.44 
 
 
113 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  51.3 
 
 
115 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  38.68 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  37.82 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  42.7 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  43.59 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  31.4 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  32.53 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  30.49 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  0.0000000000000580905 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  29.11 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  41.67 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>