19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2046 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  241  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  47.32 
 
 
127 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  48.91 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  40.34 
 
 
115 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  38.33 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  38.66 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  34.19 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  41.77 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  34.45 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  37.82 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  33.61 
 
 
113 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  35 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  41.98 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  32.63 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  26.73 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0030  hypothetical protein  30.69 
 
 
110 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1854  hypothetical protein  36.76 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  27.59 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  29.51 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>