18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2219 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  252  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  38.18 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  36.7 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  41.51 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  36.36 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  38.68 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  40.54 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  47.44 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  38.18 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  41.03 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  41.98 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  45.68 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  34.02 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  31.58 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  31.58 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  0.0000000000000580905 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  30.08 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  31.67 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>