16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2968 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  227  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  89.38 
 
 		 113 aa  208  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  84.07 
 
 		 113 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  61.06 
 
 		 114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  51.33 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  51.75 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  59.55 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  52.17 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  46.67 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  33.61 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  40.82 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  41.03 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  31.15 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  28.05 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  28.05 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  0.0000000000000580905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>