21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7320 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  230  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  55.65 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  51.3 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  51.3 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  48.7 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  46.67 
 
 		 113 aa  104  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  49.15 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  56.82 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  56.82 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  48.91 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  46.15 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  43.75 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  41.03 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  34.48 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  29.76 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  28.57 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  0.0000000000000580905 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  31.51 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1854  hypothetical protein  38.98 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  31.63 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  28.44 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0750  hypothetical protein  38.57 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>