19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1728 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  231  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  99.12 
 
 		 113 aa  229  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  54.78 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  59.55 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  51.33 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  52.21 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  47.86 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  50.44 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  56.82 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  41.77 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  47.44 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  40.85 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  39.24 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  36.27 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  33.75 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  26.72 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  32.22 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  31.11 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  0.0000000000000580905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1854  hypothetical protein  32.88 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>