17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0613 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0613  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  229  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2968  hypothetical protein  89.38 
 
 
113 aa  208  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0551  hypothetical protein  84.96 
 
 
113 aa  200  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.295838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  63.72 
 
 
114 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0869  hypothetical protein  54.87 
 
 
115 aa  138  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  56.03 
 
 
115 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  52.21 
 
 
113 aa  120  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  51.33 
 
 
113 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  48.7 
 
 
115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2219  hypothetical protein  36.7 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  47.87 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  34.45 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  34.65 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  27.68 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  28.41 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  0.0000000000000580905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  26.83 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1871  hypothetical protein  31.65 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.159127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>