21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2968 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2968  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  258  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1905  hypothetical protein  48.42 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1083  hypothetical protein  30.84 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1113  hypothetical protein  26.61 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.341492  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0270  hypothetical protein  42.42 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1051  hypothetical protein  33.64 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141356 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1418  hypothetical protein  33.75 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1728  hypothetical protein  33.75 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.267724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1985  hypothetical protein  29.06 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0688  hypothetical protein  29.06 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3361  regulatory protein, MarR  31.65 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52410  hypothetical protein  30.38 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41590  hypothetical protein  30.38 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3127  hypothetical protein  28.4 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338224  decreased coverage  0.00835036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7320  hypothetical protein  28.44 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0496  hypothetical protein  35.06 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0215  hypothetical protein  31.97 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250298  hitchhiker  0.0000000000000580905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0164  hypothetical protein  31.97 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0486  hypothetical protein  32.95 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.407371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0135  hypothetical protein  29.52 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2046  hypothetical protein  29.51 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>