26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5528 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5528  FHA domain containing protein  100 
 
 		 172 aa  343  5e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.566617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3824  FHA domain containing protein  41.72 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  0.0327459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4916  FHA domain containing protein  35.92 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2782  FHA domain containing protein  32.73 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0274726  normal  0.778814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6373  FHA domain containing protein  31.85 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5672  FHA domain containing protein  30.52 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0631654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0680  FHA domain containing protein  29.13 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2896  FHA domain containing protein  29.13 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000163435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3669  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  30.85 
 
 		 451 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163956  decreased coverage  0.0000814904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0140  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.89 
 
 		 500 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1581  FHA domain containing protein  43.14 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.10755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1753  FHA domain containing protein  39.73 
 
 		 456 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00138455 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1115  ATPase  35.37 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  35.16 
 
 		 310 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3479  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.82 
 
 		 554 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  29.33 
 
 		 279 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  32.91 
 
 		 387 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  34.23 
 
 		 409 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3334  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.82 
 
 		 554 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  30.67 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6711  putative sigma54 specific transcriptional regulator  34.78 
 
 		 448 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  35.78 
 
 		 409 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4708  FHA domain containing protein  44.44 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2818  FHA domain-containing protein  30.26 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2647  putative sigma54 specific transcriptional regulator  37.33 
 
 		 467 aa  40.8  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3181  FHA domain-containing protein  30.77 
 
 		 302 aa  40.8  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.999719  normal  0.141986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>