49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3824 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3824  FHA domain containing protein  100 
 
 
255 aa  518  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  0.0327459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5528  FHA domain containing protein  41.72 
 
 
172 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.566617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6373  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958843  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2782  FHA domain containing protein  32.8 
 
 
178 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0274726  normal  0.778814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4916  FHA domain containing protein  37.93 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5672  FHA domain containing protein  34.19 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0631654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2896  FHA domain containing protein  30.16 
 
 
182 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000163435  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0680  FHA domain containing protein  30.16 
 
 
182 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2102  FHA domain containing protein  36.71 
 
 
174 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1581  FHA domain containing protein  35 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.10755 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  34.34 
 
 
219 aa  49.7  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2598  Forkhead-associated protein  30.33 
 
 
350 aa  49.3  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00230  FHA domain-containing protein  33.06 
 
 
163 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3479  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35 
 
 
554 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3334  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35 
 
 
554 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448587  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0951  FHA-domain containing protein  28.26 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  37.33 
 
 
326 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  37.33 
 
 
338 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  37.33 
 
 
326 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  28.15 
 
 
903 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4365  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.3 
 
 
444 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000961656  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.5 
 
 
863 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.93 
 
 
899 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2818  FHA domain-containing protein  39.66 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8053  FHA repeat-domain-containing protein-like protein  31.9 
 
 
181 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0730272  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07300  FHA domain-containing protein  29.7 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26940  FHA domain-containing protein  35.53 
 
 
175 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.216801  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  36.59 
 
 
470 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3669  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  26.67 
 
 
451 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163956  decreased coverage  0.0000814904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  35.62 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0031  FHA domain containing protein  31.33 
 
 
161 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.74184  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0117  FHA domain-containing protein-like protein  28.29 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0091  FHA domain containing protein  40 
 
 
170 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3415  putative sigma54 specific transcriptional regulator  33.75 
 
 
554 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3436  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  35.85 
 
 
387 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1377  hypothetical protein  29.79 
 
 
233 aa  42.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1753  FHA domain containing protein  35.14 
 
 
456 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00138455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0116  FHA domain containing protein-like protein  32.94 
 
 
155 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851255  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2308  FHA domain-containing protein  34.25 
 
 
149 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0512464  hitchhiker  0.000482709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0921  FHA domain containing protein  29.21 
 
 
250 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  28.87 
 
 
890 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  36.17 
 
 
238 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3848  FHA domain containing protein  35.53 
 
 
149 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0147  FHA domain containing protein  33.67 
 
 
137 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6711  putative sigma54 specific transcriptional regulator  35.71 
 
 
448 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0798  FHA domain protein  35.71 
 
 
146 aa  42  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1847  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  32.47 
 
 
675 aa  42  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>