17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2736 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2736  hypothetical protein  100 
 
 		 711 aa  1380    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00181142 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.09 
 
 		 810 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 1261 aa  55.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 448 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 878 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 955 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  43.59 
 
 		 806 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 991 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  32.81 
 
 		 430 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 3560 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  21.55 
 
 		 1266 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.25 
 
 		 603 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3010  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 421 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.52 
 
 		 1034 aa  45.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 615 aa  44.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.23 
 
 		 742 aa  44.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.39 
 
 		 632 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>