More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1210 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1210  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
361 aa  730    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139786  hitchhiker  0.00000028232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6374  serine/threonine protein kinase  38.08 
 
 
489 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555242  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2783  serine/threonine protein kinase  39.19 
 
 
472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0477185  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0681  serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 
465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2897  serine/threonine protein kinase  36.98 
 
 
466 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00928102  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
641 aa  99.4  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 
360 aa  92.8  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.21 
 
 
551 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.7 
 
 
601 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  29.92 
 
 
691 aa  89.7  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.65 
 
 
1072 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.65 
 
 
1072 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  36.73 
 
 
618 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 
681 aa  89.4  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.8 
 
 
693 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.9 
 
 
650 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  33.01 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.25 
 
 
613 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  34.55 
 
 
623 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.43 
 
 
406 aa  86.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  33.15 
 
 
700 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.99 
 
 
664 aa  86.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.61 
 
 
668 aa  86.3  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  35.67 
 
 
642 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.94 
 
 
584 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  28.28 
 
 
614 aa  85.1  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  29.55 
 
 
668 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
646 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.03 
 
 
1076 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 
624 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 
624 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 
624 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  30.04 
 
 
661 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.68 
 
 
907 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.5 
 
 
662 aa  83.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.14 
 
 
613 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36 
 
 
675 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.02 
 
 
696 aa  83.2  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  29.5 
 
 
634 aa  83.2  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 
582 aa  82.8  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.19 
 
 
825 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  34.01 
 
 
615 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.68 
 
 
653 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  35.53 
 
 
658 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.29 
 
 
661 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
761 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.78 
 
 
676 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.96 
 
 
666 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 
628 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
666 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  35.97 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  32.65 
 
 
500 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.53 
 
 
681 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.76 
 
 
715 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  36.62 
 
 
646 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4796  serine/threonine protein kinase  29.47 
 
 
551 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000010036  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  31.84 
 
 
625 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
573 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.28 
 
 
645 aa  80.5  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0440  serine/threonine protein kinase  32.47 
 
 
682 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.28 
 
 
520 aa  80.5  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2676  serine/threonine protein kinase  35.95 
 
 
769 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.282843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
528 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.21 
 
 
652 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.95 
 
 
869 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.71 
 
 
1044 aa  80.1  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 
651 aa  79.7  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4222  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
551 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652875  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
625 aa  79.7  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  30.86 
 
 
620 aa  79.7  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5596  serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 
649 aa  79.7  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.09 
 
 
798 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 
562 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.17 
 
 
635 aa  79.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3843  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 
708 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.38 
 
 
718 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.65 
 
 
681 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1579  serine/threonine protein kinase  35.91 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.95 
 
 
668 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  32.6 
 
 
625 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.91 
 
 
647 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 
691 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.37 
 
 
594 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  31.22 
 
 
1057 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
522 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  29.84 
 
 
623 aa  77.4  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40725  predicted protein  31.07 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.316803  normal  0.0251732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  32.52 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  35 
 
 
723 aa  77  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0106  Serine/threonine protein kinase-like  30 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 
502 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  33.89 
 
 
598 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  27.55 
 
 
820 aa  77  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6196  serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 
1414 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  32.4 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 
691 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35 
 
 
642 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3993  serine/threonine protein kinase  32.51 
 
 
711 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.89 
 
 
620 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>