25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1994 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1994  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 422 aa  811    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0532904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1530  TrkA-C domain protein  55.08 
 
 		 405 aa  423  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.743985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3000  TrkA-C domain protein  54.61 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0578  hypothetical protein  51.73 
 
 		 414 aa  354  1e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0341  hypothetical protein  37.53 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0206  hypothetical protein  27.65 
 
 		 481 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0604666  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1995  TrkA-C domain protein  25.54 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.64747  normal  0.0535228 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0579  TrkA-C domain protein  26.18 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1531  TrkA-C domain protein  26.2 
 
 		 612 aa  60.5  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0342  hypothetical protein  25.77 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  32.81 
 
 		 221 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  32.81 
 
 		 221 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  32.81 
 
 		 221 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  32.81 
 
 		 221 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  32.81 
 
 		 221 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  32.81 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  32.81 
 
 		 221 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  32.81 
 
 		 221 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  32.81 
 
 		 221 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  32.81 
 
 		 221 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 		 221 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 		 220 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  34.83 
 
 		 668 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  37.7 
 
 		 670 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>