10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0578 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0578  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  795    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1994  TrkA-C domain protein  51.96 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0532904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1530  TrkA-C domain protein  48.46 
 
 		 405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.743985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3000  TrkA-C domain protein  47.28 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0341  hypothetical protein  41.98 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0206  hypothetical protein  28.75 
 
 		 481 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0604666  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1531  TrkA-C domain protein  27.59 
 
 		 612 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1995  TrkA-C domain protein  27.07 
 
 		 455 aa  57  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.64747  normal  0.0535228 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0342  hypothetical protein  35.29 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0579  TrkA-C domain protein  24.87 
 
 		 418 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>